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万向娱乐同時，利奧高戰士換上新服裝，增強戰力去拯救威廉及消滅山拿，傑理明製作了虛擬潛艇Skid，令利奧高戰士可以到數碼海向潛入互聯網的山拿戰鬥。在數碼海中，利奧高戰士找到名為「Replika」的山寨利奧高世界，由山拿控制全球各地的超級電腦創造而成，利奧高戰士利用Skid以虛擬的姿態傳送到各Replika所對應之超級電腦於現實世界中的位置並將超級電腦摧毀。然而山拿已前後控制了全世界超過100部以上的超級電腦，並以這些Replika的能量製作了史上最強大的怪物---熔岩巨人，利奧高戰士已不能再採用逐個擊破的策略，最終傑理明利用利奧高戰士於摧毀位於西伯利亞的超級電腦時取得的威廉傳送資料開發了將威廉救回現世的實體化程式，不但拯救了威廉，其後更利用賀法蘭的日記、資料、以及摧毀過的Replika資料，開發了摧毀全部的Replika並將山拿完全消滅的多代理系統。雖然山拿最終被消滅，但賀法爾為提供驅動多代理系統的能量及保護亞烈達啟動系統而壯烈犧牲，長久以來的戰爭終以眾人事後一致同意關閉超級電腦作結。

戰後德國還成立了兩個新的聯邦州：萊茵蘭-普法爾茨（法國占領區）和下薩克森（英國占領區），它們也選擇黑-紅-金三色旗為州旗，這三種顏色也和它們的紋章顏色相同。這兩個州都是從原來的一些聯邦州中分出來的部分重新組合產生的，由於原來的州旗顏色無法合理搭配，所以只能使用其他方案。選擇黑-紅-金三色旗有兩個主要原因：這三種顏色和組成它們的任何一個舊的聯邦州都沒有什麼特殊的聯繫，而使用原來魏瑪共和國的旗幟也標誌了新的聯邦德國。

除了應用科學，麻省理工的自然科學研究亦為蓬勃，共有近六十位諾貝爾物理學、化學、生理學或醫學獎、三位沃爾夫獎得主與此校有所聯繫。次原子粒子與量子物理學、新化學合成法、免疫學、腫瘤學、分子生物學為獲獎者所研究的領域。 麻省理工亦首次發現正子電子偶、合成型盤尼西林、肌萎縮性脊髓側索硬化症、亨丁頓舞蹈症。學校的埃里克·蘭德教授為人類基因組計劃的主力研究人員之一。傑羅姆·萊特文教授亦改寫了認知科學的發展史。